Das Fördern eines wechselseitigen Verständnisses und die Entwicklung von gemeinsamen Lösungsansätzen ist ein wichtiges Ziel des Transatlantischen Programms. Seit seiner Initiierung vor zehn Jahren sind mehr als fünfzig junge Menschen, die sich für Umweltpolitik interessieren, nach Berlin gekommen, um die Arbeit des Ecologic Institus kennenzulernen. Derzeit verbringen mindestens fünf Nachwuchswissenschaftler pro Jahr aus so unterschiedlichen Ländern wie den USA, Kanada, Mexiko oder Guatemala einen Forschungsaufenthalt beim Ecologic Institut. Die Nachfrage nach diesem Angebot ist groß und die Anzahl der teilnehmenden Nachwuchswissenschaftler sowie der Herkunftsländer wächst. Das transatlantische Programm fördert jedoch nicht nur den internationalen Forschungsaustausch sondern bietet darüber hinaus eine Plattform für regelmäßigen transatlantischen Dialog in Berlin.

Jedes Jahr lädt das Ecologic Institut Absolventen und junge Berufstätige, die für vergleichbare Institutionen arbeiten ein, eine gewisse Zeit in Berlin zu verbringen. Dort besteht die Gelegenheit, in internationalen Projektteams zu arbeiten und einen Einblick in europäische Politikthemen zu gewinnen. Auch Stipendiaten der Robert Bosch Stiftung und der Alexander von Humboldt Stiftung können ihre Zeit in Deutschland am Ecologic Institut verbringen. Der durch das Ecologic Institut ins Leben gerufene Konrad von Moltke Fonds fördert zudem junge Wissenschaftler, die sich besonders für die Themen interessieren, mit denen sich Konrad von Moltke beschäftigte, und unterstützt Forschungsaufenthalte in Berlin und in Washington.
In den letzten zehn Jahren ist der transatlantische Anteil im Arbeitsprogramm des Ecologic Instituts stark gewachsen. In vielen der internationalen Projekte, die das Ecologic Institut bearbeitet, spielt der transatlantische Dialog eine wichtige Rolle, z. B:

• I-CITE: Wirtschaftstransformation durch Gemeinschaft
• Transatlantische Kooperation für ganzheitliche Meerespolitik (CALAMAR)
• Transatlantische Politikoptionen zur Unterstützung von Adaptationsmaßnahmen in der marinen Arktis (Arctic TRANSFORM)
• Verknüpfung von öffentlichen Verkehrsmitteln mit Car- und Bike-Sharing Programmen
• Grüne Arbeitsplätze – Nachhaltiges Wachstum
• Transatlantischer Austausch von Landwirten zum Thema Bioenergie und klimafreundliche Landwirtschaft
• Dr. Jonathan Pershing und Dr. Urban Rid diskutieren über globale Klimapolitik
• Die Finanzierung von Energieeffizienzmaßnahmen in Entwicklungsländern
• Dreiteilige Seminarreihe "Der Preis der Energie"
• Transatlantischer Mediendialog: Nachhaltiger Umbau strukturschwacher Regionen
• Transatlantischer Mediendialog: Klimapolitik in Europa und den USA – Chancen und Herausforderungen für Kopenhagen und darüber hinaus
• Transatlantisches Programm des Ecologic Instituts